在少年三国志的后期阶段，武将的特殊技能学习与搭配成为提升战力的核心要素。游戏中的技能分为主动与被动两类，主动技能直接影响战斗输出和控制效果，而被动技能则提供增益或减益状态，两者结合能显著改变战局走向。部分武将的主动技能可造成高额单体伤害并附加眩晕效果，被动技能则可能在濒死时触发复活或属性强化。技能等级提升后，效果会进一步强化，如控制时间延长或治疗量增加。玩家需根据武将定位（输出、防御、辅助）选择技能培养方向，优先升级核心武将的关键技能。
同一阵营的武将组合能激活阵营加成，而特定武将间的缘分关系可解锁额外属性增益。蜀国五虎将同时上阵可触发合体技能，大幅提升团队攻防能力。部分武将的专属技能（如华佗的治疗与中毒效果）需配合特定装备或神兵才能发挥最大效用。玩家应通过副本、竞技场等活动获取技能书和觉醒材料，逐步解锁高阶技能。技能释放时机也需策略性规划，例如在敌方蓄力阶段使用控制技能打断，或在己方残血时触发群体治疗。
装备与技能联动是后期深度玩法之一。金色装备提供的特殊属性可强化技能效果，如增加暴击率或延长减益持续时间。玩家需通过挑战高阶副本获取金装，并利用洗炼功能调整属性适配武将特性。部分神兵（如丈八蛇矛、闭月团扇）能激活武将隐藏技能，需优先分配给核心输出或控制型武将。战宠系统的加入为技能体系带来新维度，橙色战宠可提供群体增益或范围伤害技能，需根据阵容需求选择培养。
团队副本和PVP玩法对技能组合要求更高。公会战、攻城争霸等活动中，控制链衔接与爆发技能配合至关重要。先手使用群体减怒技能限制敌方输出，再通过AOE技能快速清场。竞技场中则需针对主流阵容调整技能配置，如携带解控技能应对控制流派。后期版本更新可能引入新技能机制，玩家需关注平衡性调整，及时优化技能搭配策略。资源分配上，建议集中培养2-3名主力武将的技能至满级，再逐步扩展其他角色。
